وأخذ عن كبار تلاميذ والده الإمام عبدالله بن عمر الشاطري في رباط تريم وغيرهم،
أما مشائخه الحضارمة فهم كثيرون ، ومعظمهم من كبار تلامذة والده ، ومن أشهرهم:
1) شيخ الوادي الإمام علوي بن عبدالله بن شهاب الدين (1303هـ -1386هـ).
2) العلامة الشهيد محمد بن سالم بن حفيظ (1332هـ- 1392هـ).
3) الشيخ محفوظ بن سالم بن عثمان (1321هـ- 1396هـ).
4) الحبيب العلامة النحوي عمر بن علوي الكاف ( 1325هـ - 1412هـ).
5) الحبيب العارف بالله جعفر بن أحمد العيدروس (1308هـ- 1396هـ).
6) الشيخ عمر عوض حداد (ت: 1426هـ).
7) الشيخ عبدالله بن محمد بن سعيد بازغيفان.
الشيخ سالم بن سعيد بكيّر باغيثان (1323هـ- 1386هـ).
9) الشيخ فضل بن عبدالرحمن بافضل (1347هـ- 1421هـ)
10) السيد حسين بن عبدالرحمن بن شهاب الدين.
11) السيد المسند سالم بن جندان (ت: 1395هـ).
12) الشيخ العلامة محمد بن سالم البيحاني أخذ عنه في مدينة عدن (1326هـ- 1391هـ).
13) الشيخ العلامة علي بن محمد باحميش قاضي عدن ومأذونها وإمام وخطيب مسجد الإمام العيدروس بعدن (ت: 1973هـ).
14) والحبيب القدوة عبدالقادر بن أحمد السقاف .
15) كما أخذ عن إخوانه العلماء الفضلاء الحبيب محمد المهدي (ت:1404هـ) والحبيب أبوبكر (ت: 1413هـ) والحبيب حسن (ت: 1425هـ) رحمهم الله رحمة الأبرار . وغيرهم، ويبلغ عدد مشائخه ما يقارب الثمانين شيخ، وأكثرهم من تلامذة والده.
انتقاله إلى مكة المكرمة1) العلامة السيد علوي بن عباس المالكي (1327-1391هـ) الذي لازمه كثيراً وكتب عنه دروساً في التفسير وعلو القرآن والحديث وبقية العلوم،
2) والشيخ حسن بن محمد المشاط (1317-1399هـ).
3) والسيد سالم بن طالب العطاس.
4) والسيد حسن بن محمد فدعق) ت 1400 :هـ).
5) والسيد أبوبكر بن سالم البار (ت: 1384هـ).
6) والشيخ محمد نور سيف هلال المكي (1327-1403هـ).
7) والشيخ زيني بويان الجاوي.
والشيخ عبدالله بن أحمد دَرْدُوم الجاوي (ت: 1407هـ).
9) والشيخ عبدالله بخَّاش أخذ عنه علم الحساب.
10) والشيخ عبدالحميد زكريا بيلا الأندونيسي أخذ عنه في علم الفلك والربع المجيب.
11) والشيخ المسند محمد بن يا سين الفاداني أخذ عنه أيضاً في علم الفلك.
12) والشيخ عبدالله بن سعيد اللحجي الحضرمي (1344-1410هـ) في القواعد الفقهية .
13) والشيخ حسن بن سعيد يماني (1212-1319هـ) مفتي الشافعية بمكة المكرمة.
كان يتلقى طلب العلم في مكة المكرمة بالمسجد الحرام في اليوم والليلة أثنى عشر درساً في فنون شتّى ، وكلها يطالع لها ويلخصها
جهوده في نشر العلم والمحن التي تعرض لها